Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRAP54198 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRAP54198 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRAP54198 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRAP54198 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRAP54198 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRAP54198 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRAP54198 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRAP54198 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRAP54198 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRAP54198 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRAP54198 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRAP54198 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRAP54198 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIRAP54198 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRAP54198 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRAP54198 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRAP54198 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRAP54198 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRAP54198 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRAP54198 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRAP54198 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRAP54198 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRAP54198 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRAP54198 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRAP54198 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRAP54198 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIRAP54198 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRAP54198 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRAP54198 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRAP54198 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRAP54198 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRAP54198 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRAP54198 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRAP54198 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRAP54198 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIRAP54198 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRAP54198 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRAP54198 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRAP54198 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRAP54198 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRAP54198 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRAP54198 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRAP54198 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRAP54198 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRAP54198 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIRAP54198 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRAP54198 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRAP54198 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRAP54198 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRAP54198 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRAP54198 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRAP54198 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRAP54198 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRAP54198 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRAP54198 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRAP54198 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRAP54198 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRAP54198 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRAP54198 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRAP54198 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRAP54198 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRAP54198 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRAP54198 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRAP54198 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRAP54198 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRAP54198 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRAP54198 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRAP54198 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRAP54198 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRAP54198 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRAP54198 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRAP54198 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRAP54198 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRAP54198 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRAP54198 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRAP54198 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRAP54198 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRAP54198 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRAP54198 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRAP54198 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRAP54198 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRAP54198 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRAP54198 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRAP54198 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRAP54198 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRAP54198 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRAP54198 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRAP54198 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRAP54198 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRAP54198 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRAP54198 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRAP54198 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRAP54198 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRAP54198 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRAP54198 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRAP54198 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
HIRAP54198 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIRAP54198 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIRAP54198 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms