Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA8P53708 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA8P53708 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms