Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACLYP53396 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACLYP53396 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACLYP53396 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACLYP53396 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACLYP53396 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACLYP53396 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACLYP53396 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACLYP53396 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACLYP53396 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACLYP53396 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACLYP53396 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACLYP53396 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACLYP53396 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACLYP53396 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACLYP53396 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACLYP53396 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACLYP53396 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACLYP53396 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACLYP53396 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACLYP53396 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACLYP53396 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACLYP53396 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACLYP53396 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACLYP53396 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACLYP53396 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACLYP53396 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACLYP53396 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACLYP53396 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACLYP53396 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACLYP53396 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACLYP53396 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACLYP53396 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACLYP53396 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACLYP53396 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACLYP53396 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACLYP53396 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACLYP53396 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACLYP53396 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACLYP53396 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACLYP53396 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACLYP53396 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACLYP53396 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACLYP53396 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACLYP53396 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACLYP53396 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ACLYP53396 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACLYP53396 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACLYP53396 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACLYP53396 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACLYP53396 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACLYP53396 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ACLYP53396 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACLYP53396 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACLYP53396 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACLYP53396 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACLYP53396 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACLYP53396 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ACLYP53396 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACLYP53396 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACLYP53396 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACLYP53396 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACLYP53396 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACLYP53396 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACLYP53396 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACLYP53396 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACLYP53396 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACLYP53396 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACLYP53396 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACLYP53396 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACLYP53396 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACLYP53396 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACLYP53396 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ACLYP53396 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACLYP53396 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACLYP53396 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACLYP53396 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACLYP53396 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACLYP53396 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms