Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA4P52798 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA4P52798 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms