Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDR1P51861 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDR1P51861 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDR1P51861 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDR1P51861 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDR1P51861 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDR1P51861 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDR1P51861 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDR1P51861 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDR1P51861 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDR1P51861 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDR1P51861 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDR1P51861 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR1P51861 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR1P51861 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR1P51861 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR1P51861 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR1P51861 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR1P51861 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR1P51861 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR1P51861 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR1P51861 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR1P51861 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR1P51861 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR1P51861 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDR1P51861 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR1P51861 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR1P51861 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR1P51861 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR1P51861 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR1P51861 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR1P51861 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR1P51861 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR1P51861 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR1P51861 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR1P51861 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR1P51861 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR1P51861 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR1P51861 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR1P51861 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR1P51861 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR1P51861 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR1P51861 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDR1P51861 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR1P51861 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR1P51861 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR1P51861 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR1P51861 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR1P51861 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR1P51861 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR1P51861 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR1P51861 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR1P51861 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR1P51861 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR1P51861 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR1P51861 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR1P51861 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR1P51861 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR1P51861 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR1P51861 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR1P51861 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR1P51861 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR1P51861 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR1P51861 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR1P51861 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR1P51861 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR1P51861 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR1P51861 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR1P51861 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR1P51861 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR1P51861 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR1P51861 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR1P51861 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR1P51861 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR1P51861 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR1P51861 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR1P51861 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR1P51861 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR1P51861 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR1P51861 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR1P51861 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR1P51861 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR1P51861 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR1P51861 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR1P51861 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR1P51861 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR1P51861 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR1P51861 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR1P51861 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDR1P51861 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDR1P51861 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDR1P51861 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDR1P51861 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDR1P51861 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDR1P51861 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDR1P51861 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDR1P51861 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDR1P51861 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDR1P51861 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDR1P51861 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms