Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ1P51787 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1P51787 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms