Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR5P51681 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR5P51681 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR5P51681 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR5P51681 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR5P51681 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR5P51681 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR5P51681 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR5P51681 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR5P51681 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCR5P51681 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCR5P51681 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCR5P51681 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCR5P51681 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCR5P51681 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCR5P51681 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCR5P51681 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCR5P51681 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCR5P51681 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCR5P51681 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCR5P51681 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCR5P51681 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCR5P51681 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCR5P51681 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCR5P51681 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCR5P51681 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCR5P51681 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR5P51681 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR5P51681 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR5P51681 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR5P51681 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR5P51681 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR5P51681 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR5P51681 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR5P51681 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR5P51681 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR5P51681 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR5P51681 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR5P51681 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCR5P51681 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR5P51681 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR5P51681 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR5P51681 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR5P51681 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR5P51681 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR5P51681 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR5P51681 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR5P51681 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR5P51681 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR5P51681 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR5P51681 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR5P51681 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCR5P51681 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCR5P51681 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCR5P51681 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCR5P51681 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCR5P51681 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCR5P51681 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCR5P51681 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCR5P51681 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCR5P51681 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCR5P51681 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCR5P51681 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCR5P51681 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCR5P51681 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCR5P51681 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCR5P51681 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCR5P51681 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCR5P51681 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCR5P51681 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCR5P51681 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCR5P51681 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCR5P51681 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR5P51681 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR5P51681 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR5P51681 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR5P51681 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR5P51681 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR5P51681 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR5P51681 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR5P51681 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR5P51681 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR5P51681 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR5P51681 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR5P51681 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCR5P51681 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR5P51681 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR5P51681 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR5P51681 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR5P51681 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR5P51681 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR5P51681 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR5P51681 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR5P51681 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR5P51681 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR5P51681 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR5P51681 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR5P51681 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR5P51681 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCR5P51681 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms