Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRCA2P51587 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms