Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCT4P50991 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCT4P50991 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCT4P50991 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCT4P50991 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCT4P50991 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCT4P50991 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCT4P50991 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCT4P50991 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCT4P50991 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCT4P50991 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCT4P50991 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CCT4P50991 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCT4P50991 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCT4P50991 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCT4P50991 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCT4P50991 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCT4P50991 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCT4P50991 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCT4P50991 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCT4P50991 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCT4P50991 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCT4P50991 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCT4P50991 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCT4P50991 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCT4P50991 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCT4P50991 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCT4P50991 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT4P50991 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT4P50991 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT4P50991 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT4P50991 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT4P50991 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT4P50991 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT4P50991 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCT4P50991 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCT4P50991 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCT4P50991 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCT4P50991 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCT4P50991 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCT4P50991 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCT4P50991 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCT4P50991 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCT4P50991 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCT4P50991 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCT4P50991 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCT4P50991 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCT4P50991 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT4P50991 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT4P50991 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT4P50991 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT4P50991 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT4P50991 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT4P50991 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT4P50991 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT4P50991 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT4P50991 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT4P50991 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT4P50991 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT4P50991 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT4P50991 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT4P50991 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT4P50991 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT4P50991 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT4P50991 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT4P50991 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT4P50991 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT4P50991 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT4P50991 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT4P50991 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT4P50991 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT4P50991 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT4P50991 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT4P50991 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT4P50991 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT4P50991 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT4P50991 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT4P50991 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT4P50991 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT4P50991 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT4P50991 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT4P50991 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT4P50991 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT4P50991 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT4P50991 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT4P50991 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT4P50991 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT4P50991 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCT4P50991 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCT4P50991 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCT4P50991 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCT4P50991 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCT4P50991 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCT4P50991 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCT4P50991 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCT4P50991 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCT4P50991 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCT4P50991 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCT4P50991 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCT4P50991 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms