Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATMP50440 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATMP50440 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATMP50440 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATMP50440 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATMP50440 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATMP50440 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATMP50440 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATMP50440 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATMP50440 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATMP50440 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATMP50440 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATMP50440 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATMP50440 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATMP50440 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GATMP50440 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GATMP50440 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATMP50440 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATMP50440 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATMP50440 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATMP50440 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATMP50440 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATMP50440 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATMP50440 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATMP50440 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATMP50440 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GATMP50440 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATMP50440 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATMP50440 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATMP50440 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATMP50440 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATMP50440 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GATMP50440 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GATMP50440 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GATMP50440 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GATMP50440 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GATMP50440 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GATMP50440 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GATMP50440 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GATMP50440 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATMP50440 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATMP50440 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATMP50440 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATMP50440 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATMP50440 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATMP50440 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATMP50440 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATMP50440 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATMP50440 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATMP50440 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATMP50440 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATMP50440 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATMP50440 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATMP50440 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATMP50440 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATMP50440 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATMP50440 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATMP50440 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATMP50440 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GATMP50440 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATMP50440 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATMP50440 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATMP50440 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATMP50440 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATMP50440 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATMP50440 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATMP50440 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATMP50440 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATMP50440 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATMP50440 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATMP50440 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATMP50440 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATMP50440 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATMP50440 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATMP50440 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATMP50440 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GATMP50440 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATMP50440 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GATMP50440 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATMP50440 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATMP50440 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATMP50440 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATMP50440 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATMP50440 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATMP50440 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATMP50440 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATMP50440 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATMP50440 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATMP50440 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATMP50440 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GATMP50440 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATMP50440 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATMP50440 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATMP50440 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATMP50440 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATMP50440 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATMP50440 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATMP50440 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATMP50440 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATMP50440 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms