Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CRIP1P50238 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRIP1P50238 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms