Protein–RNA interactions for Protein: P49917

LIG4, DNA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG4P49917 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIG4P49917 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIG4P49917 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIG4P49917 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIG4P49917 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIG4P49917 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIG4P49917 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIG4P49917 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIG4P49917 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIG4P49917 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIG4P49917 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIG4P49917 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIG4P49917 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIG4P49917 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIG4P49917 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIG4P49917 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LIG4P49917 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIG4P49917 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIG4P49917 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LIG4P49917 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIG4P49917 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIG4P49917 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIG4P49917 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIG4P49917 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIG4P49917 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIG4P49917 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIG4P49917 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIG4P49917 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIG4P49917 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIG4P49917 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIG4P49917 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LIG4P49917 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIG4P49917 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LIG4P49917 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIG4P49917 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG4P49917 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG4P49917 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG4P49917 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG4P49917 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG4P49917 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG4P49917 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG4P49917 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG4P49917 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG4P49917 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG4P49917 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG4P49917 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG4P49917 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG4P49917 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG4P49917 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG4P49917 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG4P49917 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG4P49917 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG4P49917 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG4P49917 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG4P49917 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG4P49917 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG4P49917 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG4P49917 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG4P49917 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG4P49917 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG4P49917 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG4P49917 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG4P49917 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG4P49917 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG4P49917 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG4P49917 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG4P49917 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG4P49917 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG4P49917 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG4P49917 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG4P49917 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG4P49917 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG4P49917 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG4P49917 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG4P49917 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG4P49917 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG4P49917 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG4P49917 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG4P49917 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG4P49917 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms