Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF6P49848 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF6P49848 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF6P49848 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF6P49848 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF6P49848 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF6P49848 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF6P49848 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF6P49848 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF6P49848 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF6P49848 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF6P49848 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF6P49848 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF6P49848 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF6P49848 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF6P49848 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF6P49848 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF6P49848 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF6P49848 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF6P49848 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF6P49848 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF6P49848 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF6P49848 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF6P49848 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF6P49848 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF6P49848 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF6P49848 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF6P49848 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF6P49848 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF6P49848 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF6P49848 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF6P49848 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF6P49848 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF6P49848 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF6P49848 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF6P49848 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF6P49848 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF6P49848 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF6P49848 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF6P49848 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF6P49848 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF6P49848 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF6P49848 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF6P49848 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF6P49848 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF6P49848 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF6P49848 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF6P49848 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF6P49848 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF6P49848 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF6P49848 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF6P49848 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF6P49848 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF6P49848 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF6P49848 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF6P49848 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF6P49848 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF6P49848 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF6P49848 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF6P49848 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF6P49848 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF6P49848 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF6P49848 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF6P49848 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF6P49848 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF6P49848 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF6P49848 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF6P49848 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF6P49848 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF6P49848 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF6P49848 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF6P49848 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF6P49848 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF6P49848 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF6P49848 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF6P49848 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF6P49848 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms