Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUP153P49790 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUP153P49790 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUP153P49790 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUP153P49790 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
NUP153P49790 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
NUP153P49790 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NUP153P49790 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NUP153P49790 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NUP153P49790 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NUP153P49790 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NUP153P49790 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NUP153P49790 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NUP153P49790 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NUP153P49790 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUP153P49790 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUP153P49790 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUP153P49790 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUP153P49790 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
NUP153P49790 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
NUP153P49790 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
NUP153P49790 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUP153P49790 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
NUP153P49790 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NUP153P49790 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NUP153P49790 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NUP153P49790 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NUP153P49790 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NUP153P49790 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
NUP153P49790 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NUP153P49790 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
NUP153P49790 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NUP153P49790 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NUP153P49790 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NUP153P49790 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NUP153P49790 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NUP153P49790 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NUP153P49790 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NUP153P49790 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
NUP153P49790 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NUP153P49790 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NUP153P49790 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NUP153P49790 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NUP153P49790 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NUP153P49790 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NUP153P49790 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NUP153P49790 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NUP153P49790 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NUP153P49790 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NUP153P49790 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NUP153P49790 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NUP153P49790 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NUP153P49790 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NUP153P49790 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
NUP153P49790 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NUP153P49790 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NUP153P49790 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NUP153P49790 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
NUP153P49790 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NUP153P49790 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NUP153P49790 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NUP153P49790 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NUP153P49790 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NUP153P49790 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NUP153P49790 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NUP153P49790 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NUP153P49790 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NUP153P49790 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NUP153P49790 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NUP153P49790 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NUP153P49790 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NUP153P49790 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NUP153P49790 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NUP153P49790 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUP153P49790 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUP153P49790 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NUP153P49790 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUP153P49790 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUP153P49790 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NUP153P49790 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUP153P49790 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUP153P49790 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUP153P49790 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUP153P49790 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUP153P49790 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUP153P49790 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
NUP153P49790 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
NUP153P49790 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NUP153P49790 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NUP153P49790 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NUP153P49790 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NUP153P49790 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NUP153P49790 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NUP153P49790 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NUP153P49790 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NUP153P49790 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NUP153P49790 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NUP153P49790 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NUP153P49790 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NUP153P49790 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms