Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RXRGP48443 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RXRGP48443 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RXRGP48443 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RXRGP48443 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RXRGP48443 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RXRGP48443 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RXRGP48443 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RXRGP48443 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RXRGP48443 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RXRGP48443 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RXRGP48443 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RXRGP48443 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RXRGP48443 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RXRGP48443 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RXRGP48443 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RXRGP48443 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RXRGP48443 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RXRGP48443 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RXRGP48443 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RXRGP48443 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RXRGP48443 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RXRGP48443 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RXRGP48443 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RXRGP48443 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RXRGP48443 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RXRGP48443 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RXRGP48443 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RXRGP48443 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RXRGP48443 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RXRGP48443 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RXRGP48443 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RXRGP48443 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RXRGP48443 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RXRGP48443 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RXRGP48443 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RXRGP48443 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RXRGP48443 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RXRGP48443 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RXRGP48443 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RXRGP48443 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RXRGP48443 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RXRGP48443 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RXRGP48443 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RXRGP48443 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RXRGP48443 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RXRGP48443 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RXRGP48443 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RXRGP48443 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RXRGP48443 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RXRGP48443 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RXRGP48443 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RXRGP48443 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RXRGP48443 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RXRGP48443 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RXRGP48443 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RXRGP48443 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RXRGP48443 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RXRGP48443 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RXRGP48443 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RXRGP48443 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RXRGP48443 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RXRGP48443 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RXRGP48443 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RXRGP48443 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RXRGP48443 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RXRGP48443 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RXRGP48443 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RXRGP48443 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RXRGP48443 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RXRGP48443 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RXRGP48443 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RXRGP48443 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RXRGP48443 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RXRGP48443 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RXRGP48443 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RXRGP48443 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RXRGP48443 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RXRGP48443 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RXRGP48443 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RXRGP48443 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RXRGP48443 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RXRGP48443 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RXRGP48443 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RXRGP48443 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RXRGP48443 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RXRGP48443 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RXRGP48443 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RXRGP48443 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RXRGP48443 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RXRGP48443 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RXRGP48443 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RXRGP48443 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RXRGP48443 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RXRGP48443 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RXRGP48443 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RXRGP48443 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RXRGP48443 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RXRGP48443 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RXRGP48443 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms