Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UTRNP46939 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UTRNP46939 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UTRNP46939 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UTRNP46939 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
UTRNP46939 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UTRNP46939 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
UTRNP46939 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
UTRNP46939 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
UTRNP46939 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UTRNP46939 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UTRNP46939 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UTRNP46939 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UTRNP46939 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UTRNP46939 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UTRNP46939 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UTRNP46939 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UTRNP46939 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UTRNP46939 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UTRNP46939 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UTRNP46939 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UTRNP46939 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UTRNP46939 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UTRNP46939 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UTRNP46939 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UTRNP46939 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UTRNP46939 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UTRNP46939 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UTRNP46939 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UTRNP46939 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UTRNP46939 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UTRNP46939 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UTRNP46939 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UTRNP46939 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UTRNP46939 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UTRNP46939 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UTRNP46939 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UTRNP46939 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UTRNP46939 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UTRNP46939 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UTRNP46939 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UTRNP46939 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UTRNP46939 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UTRNP46939 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UTRNP46939 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UTRNP46939 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UTRNP46939 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UTRNP46939 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UTRNP46939 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UTRNP46939 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UTRNP46939 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UTRNP46939 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UTRNP46939 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UTRNP46939 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UTRNP46939 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UTRNP46939 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UTRNP46939 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UTRNP46939 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
UTRNP46939 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UTRNP46939 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UTRNP46939 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UTRNP46939 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UTRNP46939 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UTRNP46939 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UTRNP46939 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UTRNP46939 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UTRNP46939 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UTRNP46939 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UTRNP46939 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
UTRNP46939 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UTRNP46939 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UTRNP46939 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UTRNP46939 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UTRNP46939 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UTRNP46939 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UTRNP46939 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UTRNP46939 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UTRNP46939 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UTRNP46939 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UTRNP46939 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UTRNP46939 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UTRNP46939 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UTRNP46939 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UTRNP46939 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UTRNP46939 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UTRNP46939 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UTRNP46939 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UTRNP46939 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UTRNP46939 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UTRNP46939 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UTRNP46939 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UTRNP46939 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UTRNP46939 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UTRNP46939 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
UTRNP46939 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UTRNP46939 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
UTRNP46939 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
UTRNP46939 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UTRNP46939 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UTRNP46939 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms