Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP13P45452 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP13P45452 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP13P45452 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP13P45452 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP13P45452 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP13P45452 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP13P45452 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP13P45452 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP13P45452 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP13P45452 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP13P45452 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP13P45452 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP13P45452 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP13P45452 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP13P45452 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP13P45452 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP13P45452 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP13P45452 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MMP13P45452 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MMP13P45452 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MMP13P45452 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MMP13P45452 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP13P45452 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP13P45452 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP13P45452 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP13P45452 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP13P45452 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP13P45452 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP13P45452 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP13P45452 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP13P45452 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP13P45452 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP13P45452 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP13P45452 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP13P45452 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP13P45452 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP13P45452 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP13P45452 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP13P45452 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP13P45452 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP13P45452 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP13P45452 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP13P45452 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP13P45452 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP13P45452 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP13P45452 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP13P45452 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP13P45452 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP13P45452 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP13P45452 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP13P45452 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP13P45452 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP13P45452 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP13P45452 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP13P45452 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP13P45452 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP13P45452 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP13P45452 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP13P45452 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP13P45452 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP13P45452 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP13P45452 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP13P45452 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP13P45452 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP13P45452 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP13P45452 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP13P45452 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP13P45452 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP13P45452 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP13P45452 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP13P45452 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP13P45452 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP13P45452 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP13P45452 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP13P45452 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP13P45452 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP13P45452 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP13P45452 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP13P45452 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP13P45452 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP13P45452 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP13P45452 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP13P45452 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP13P45452 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP13P45452 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP13P45452 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP13P45452 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP13P45452 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP13P45452 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP13P45452 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP13P45452 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP13P45452 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP13P45452 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP13P45452 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP13P45452 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP13P45452 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP13P45452 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP13P45452 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP13P45452 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms