Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGER3P43115 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER3P43115 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms