Protein–RNA interactions for Protein: P41240

CSK, Tyrosine-protein kinase CSK, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSKP41240 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSKP41240 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSKP41240 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSKP41240 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSKP41240 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSKP41240 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSKP41240 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSKP41240 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSKP41240 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSKP41240 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSKP41240 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSKP41240 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSKP41240 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSKP41240 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSKP41240 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSKP41240 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSKP41240 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSKP41240 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSKP41240 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSKP41240 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSKP41240 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSKP41240 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSKP41240 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSKP41240 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSKP41240 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSKP41240 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSKP41240 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSKP41240 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSKP41240 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSKP41240 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSKP41240 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSKP41240 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSKP41240 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSKP41240 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSKP41240 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSKP41240 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSKP41240 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSKP41240 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSKP41240 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSKP41240 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSKP41240 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSKP41240 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSKP41240 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSKP41240 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSKP41240 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSKP41240 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSKP41240 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSKP41240 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSKP41240 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSKP41240 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSKP41240 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSKP41240 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSKP41240 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSKP41240 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSKP41240 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSKP41240 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSKP41240 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSKP41240 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSKP41240 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSKP41240 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSKP41240 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSKP41240 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSKP41240 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSKP41240 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSKP41240 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSKP41240 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSKP41240 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSKP41240 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSKP41240 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSKP41240 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSKP41240 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSKP41240 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSKP41240 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSKP41240 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSKP41240 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSKP41240 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSKP41240 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSKP41240 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSKP41240 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSKP41240 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSKP41240 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSKP41240 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSKP41240 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSKP41240 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSKP41240 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSKP41240 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSKP41240 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSKP41240 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSKP41240 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSKP41240 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSKP41240 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSKP41240 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSKP41240 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSKP41240 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSKP41240 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSKP41240 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSKP41240 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSKP41240 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSKP41240 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSKP41240 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms