Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNFP41002 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNFP41002 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNFP41002 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNFP41002 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNFP41002 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNFP41002 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNFP41002 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNFP41002 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNFP41002 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNFP41002 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNFP41002 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNFP41002 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNFP41002 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNFP41002 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNFP41002 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNFP41002 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNFP41002 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNFP41002 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNFP41002 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNFP41002 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNFP41002 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNFP41002 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNFP41002 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNFP41002 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNFP41002 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNFP41002 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNFP41002 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNFP41002 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNFP41002 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNFP41002 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNFP41002 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNFP41002 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNFP41002 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNFP41002 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNFP41002 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNFP41002 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNFP41002 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCNFP41002 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCNFP41002 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCNFP41002 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNFP41002 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNFP41002 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNFP41002 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNFP41002 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNFP41002 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNFP41002 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNFP41002 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNFP41002 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNFP41002 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNFP41002 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNFP41002 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNFP41002 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNFP41002 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNFP41002 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNFP41002 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNFP41002 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNFP41002 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNFP41002 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNFP41002 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNFP41002 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNFP41002 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNFP41002 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNFP41002 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNFP41002 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNFP41002 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNFP41002 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNFP41002 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNFP41002 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNFP41002 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNFP41002 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNFP41002 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNFP41002 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNFP41002 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNFP41002 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNFP41002 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNFP41002 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNFP41002 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNFP41002 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNFP41002 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNFP41002 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNFP41002 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNFP41002 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNFP41002 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNFP41002 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNFP41002 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNFP41002 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNFP41002 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNFP41002 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNFP41002 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNFP41002 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNFP41002 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNFP41002 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNFP41002 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNFP41002 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNFP41002 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNFP41002 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNFP41002 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNFP41002 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNFP41002 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
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