Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYH11P35749 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYH11P35749 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MYH11P35749 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYH11P35749 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYH11P35749 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYH11P35749 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYH11P35749 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYH11P35749 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYH11P35749 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYH11P35749 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYH11P35749 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYH11P35749 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYH11P35749 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYH11P35749 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYH11P35749 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYH11P35749 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MYH11P35749 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYH11P35749 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYH11P35749 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYH11P35749 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYH11P35749 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MYH11P35749 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYH11P35749 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYH11P35749 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYH11P35749 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYH11P35749 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYH11P35749 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYH11P35749 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYH11P35749 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYH11P35749 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MYH11P35749 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYH11P35749 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYH11P35749 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYH11P35749 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYH11P35749 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYH11P35749 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYH11P35749 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYH11P35749 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYH11P35749 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYH11P35749 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYH11P35749 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYH11P35749 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYH11P35749 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYH11P35749 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYH11P35749 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYH11P35749 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MYH11P35749 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MYH11P35749 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MYH11P35749 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYH11P35749 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYH11P35749 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYH11P35749 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYH11P35749 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYH11P35749 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYH11P35749 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYH11P35749 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYH11P35749 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYH11P35749 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYH11P35749 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYH11P35749 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYH11P35749 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYH11P35749 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYH11P35749 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYH11P35749 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYH11P35749 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYH11P35749 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYH11P35749 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYH11P35749 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYH11P35749 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYH11P35749 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MYH11P35749 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYH11P35749 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYH11P35749 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYH11P35749 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYH11P35749 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYH11P35749 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYH11P35749 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms