Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms