Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDIT3P35638 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDIT3P35638 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms