Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXD13P35453 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD13P35453 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms