Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RCVRNP35243 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCVRNP35243 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCVRNP35243 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCVRNP35243 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCVRNP35243 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCVRNP35243 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCVRNP35243 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCVRNP35243 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCVRNP35243 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCVRNP35243 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCVRNP35243 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCVRNP35243 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCVRNP35243 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms