Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX1P32242 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX1P32242 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX1P32242 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX1P32242 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX1P32242 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX1P32242 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX1P32242 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX1P32242 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX1P32242 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX1P32242 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX1P32242 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX1P32242 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX1P32242 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX1P32242 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX1P32242 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX1P32242 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX1P32242 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX1P32242 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX1P32242 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX1P32242 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX1P32242 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX1P32242 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX1P32242 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX1P32242 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX1P32242 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX1P32242 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX1P32242 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX1P32242 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX1P32242 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX1P32242 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX1P32242 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX1P32242 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX1P32242 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX1P32242 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX1P32242 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX1P32242 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX1P32242 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX1P32242 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX1P32242 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX1P32242 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX1P32242 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX1P32242 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX1P32242 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX1P32242 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX1P32242 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX1P32242 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX1P32242 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX1P32242 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX1P32242 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
OTX1P32242 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
OTX1P32242 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
OTX1P32242 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX1P32242 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX1P32242 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX1P32242 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX1P32242 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX1P32242 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX1P32242 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX1P32242 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX1P32242 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX1P32242 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX1P32242 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX1P32242 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX1P32242 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX1P32242 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX1P32242 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX1P32242 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX1P32242 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX1P32242 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX1P32242 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX1P32242 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX1P32242 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX1P32242 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX1P32242 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX1P32242 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX1P32242 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX1P32242 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX1P32242 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX1P32242 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX1P32242 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX1P32242 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX1P32242 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX1P32242 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX1P32242 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX1P32242 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX1P32242 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX1P32242 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX1P32242 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX1P32242 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX1P32242 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX1P32242 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX1P32242 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX1P32242 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX1P32242 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX1P32242 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX1P32242 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX1P32242 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX1P32242 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX1P32242 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms