Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms