Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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