Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCKSP29966 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCKSP29966 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCKSP29966 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCKSP29966 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCKSP29966 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCKSP29966 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCKSP29966 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCKSP29966 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCKSP29966 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCKSP29966 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCKSP29966 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCKSP29966 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCKSP29966 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCKSP29966 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms