Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRMP28827 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRMP28827 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
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