Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LOXP28300 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXP28300 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXP28300 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXP28300 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXP28300 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXP28300 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXP28300 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXP28300 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXP28300 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXP28300 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXP28300 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXP28300 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXP28300 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXP28300 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXP28300 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXP28300 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXP28300 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LOXP28300 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXP28300 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXP28300 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXP28300 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXP28300 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXP28300 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXP28300 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXP28300 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXP28300 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXP28300 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXP28300 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXP28300 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXP28300 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXP28300 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXP28300 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXP28300 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXP28300 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXP28300 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXP28300 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXP28300 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXP28300 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXP28300 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXP28300 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXP28300 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXP28300 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXP28300 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXP28300 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXP28300 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXP28300 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXP28300 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXP28300 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXP28300 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXP28300 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXP28300 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXP28300 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXP28300 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LOXP28300 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXP28300 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXP28300 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXP28300 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXP28300 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXP28300 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXP28300 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXP28300 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXP28300 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXP28300 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXP28300 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXP28300 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXP28300 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXP28300 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXP28300 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXP28300 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXP28300 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXP28300 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXP28300 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXP28300 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXP28300 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXP28300 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXP28300 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXP28300 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXP28300 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXP28300 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXP28300 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXP28300 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXP28300 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXP28300 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXP28300 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXP28300 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXP28300 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXP28300 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXP28300 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXP28300 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXP28300 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXP28300 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXP28300 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXP28300 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXP28300 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXP28300 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXP28300 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXP28300 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXP28300 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXP28300 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms