Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB5P28074 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms