Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMLP26374 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMLP26374 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMLP26374 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMLP26374 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMLP26374 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMLP26374 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMLP26374 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMLP26374 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMLP26374 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMLP26374 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMLP26374 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMLP26374 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMLP26374 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMLP26374 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMLP26374 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMLP26374 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMLP26374 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMLP26374 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMLP26374 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMLP26374 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMLP26374 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMLP26374 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMLP26374 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMLP26374 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMLP26374 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMLP26374 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMLP26374 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMLP26374 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMLP26374 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMLP26374 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMLP26374 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMLP26374 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMLP26374 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMLP26374 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMLP26374 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMLP26374 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMLP26374 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMLP26374 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMLP26374 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMLP26374 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMLP26374 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMLP26374 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMLP26374 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMLP26374 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMLP26374 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMLP26374 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMLP26374 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMLP26374 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMLP26374 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMLP26374 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMLP26374 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMLP26374 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMLP26374 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMLP26374 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMLP26374 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMLP26374 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMLP26374 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMLP26374 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMLP26374 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMLP26374 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMLP26374 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMLP26374 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMLP26374 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMLP26374 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMLP26374 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMLP26374 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMLP26374 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMLP26374 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMLP26374 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMLP26374 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMLP26374 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMLP26374 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMLP26374 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHMLP26374 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CHMLP26374 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHMLP26374 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHMLP26374 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CHMLP26374 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHMLP26374 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHMLP26374 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHMLP26374 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHMLP26374 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHMLP26374 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHMLP26374 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHMLP26374 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHMLP26374 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHMLP26374 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMLP26374 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMLP26374 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMLP26374 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMLP26374 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMLP26374 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMLP26374 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMLP26374 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMLP26374 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMLP26374 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMLP26374 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMLP26374 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMLP26374 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms