Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN3P26045 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN3P26045 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms