Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTX3P26022 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTX3P26022 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTX3P26022 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTX3P26022 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTX3P26022 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTX3P26022 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTX3P26022 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTX3P26022 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTX3P26022 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTX3P26022 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTX3P26022 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTX3P26022 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTX3P26022 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTX3P26022 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTX3P26022 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTX3P26022 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTX3P26022 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTX3P26022 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTX3P26022 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTX3P26022 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTX3P26022 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTX3P26022 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTX3P26022 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTX3P26022 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTX3P26022 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTX3P26022 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTX3P26022 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTX3P26022 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTX3P26022 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTX3P26022 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTX3P26022 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTX3P26022 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTX3P26022 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTX3P26022 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTX3P26022 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTX3P26022 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTX3P26022 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTX3P26022 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTX3P26022 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTX3P26022 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTX3P26022 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTX3P26022 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTX3P26022 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTX3P26022 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTX3P26022 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTX3P26022 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTX3P26022 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTX3P26022 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTX3P26022 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTX3P26022 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTX3P26022 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTX3P26022 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTX3P26022 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTX3P26022 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTX3P26022 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTX3P26022 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTX3P26022 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms