Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3P25205 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3P25205 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3P25205 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3P25205 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3P25205 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3P25205 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3P25205 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3P25205 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3P25205 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3P25205 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCM3P25205 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCM3P25205 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCM3P25205 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCM3P25205 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCM3P25205 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3P25205 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3P25205 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3P25205 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3P25205 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3P25205 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3P25205 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3P25205 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3P25205 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3P25205 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3P25205 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3P25205 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3P25205 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3P25205 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3P25205 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3P25205 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3P25205 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3P25205 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3P25205 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3P25205 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3P25205 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3P25205 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3P25205 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3P25205 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3P25205 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3P25205 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3P25205 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3P25205 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3P25205 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM3P25205 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM3P25205 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM3P25205 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM3P25205 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM3P25205 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM3P25205 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM3P25205 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM3P25205 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM3P25205 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM3P25205 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM3P25205 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM3P25205 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM3P25205 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM3P25205 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM3P25205 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM3P25205 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM3P25205 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM3P25205 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM3P25205 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCM3P25205 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCM3P25205 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCM3P25205 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCM3P25205 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCM3P25205 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCM3P25205 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCM3P25205 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCM3P25205 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCM3P25205 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCM3P25205 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCM3P25205 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCM3P25205 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCM3P25205 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCM3P25205 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCM3P25205 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCM3P25205 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCM3P25205 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCM3P25205 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCM3P25205 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCM3P25205 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCM3P25205 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCM3P25205 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCM3P25205 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MCM3P25205 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCM3P25205 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCM3P25205 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCM3P25205 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCM3P25205 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3P25205 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3P25205 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3P25205 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3P25205 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3P25205 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3P25205 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3P25205 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3P25205 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3P25205 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms