Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNE1P24864 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNE1P24864 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms