Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPS6KB1P23443 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPS6KB1P23443 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms