Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms