Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT1P21579 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT1P21579 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT1P21579 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT1P21579 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT1P21579 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT1P21579 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT1P21579 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT1P21579 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT1P21579 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT1P21579 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT1P21579 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT1P21579 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT1P21579 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT1P21579 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT1P21579 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT1P21579 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT1P21579 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT1P21579 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT1P21579 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT1P21579 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT1P21579 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT1P21579 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT1P21579 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT1P21579 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT1P21579 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT1P21579 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT1P21579 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT1P21579 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT1P21579 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT1P21579 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT1P21579 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT1P21579 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT1P21579 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT1P21579 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT1P21579 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT1P21579 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT1P21579 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT1P21579 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT1P21579 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT1P21579 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT1P21579 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT1P21579 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT1P21579 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT1P21579 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT1P21579 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT1P21579 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT1P21579 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT1P21579 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT1P21579 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT1P21579 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT1P21579 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT1P21579 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT1P21579 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT1P21579 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT1P21579 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT1P21579 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT1P21579 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT1P21579 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT1P21579 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT1P21579 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT1P21579 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT1P21579 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT1P21579 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT1P21579 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT1P21579 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT1P21579 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT1P21579 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT1P21579 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT1P21579 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT1P21579 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT1P21579 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT1P21579 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT1P21579 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT1P21579 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT1P21579 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT1P21579 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT1P21579 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT1P21579 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT1P21579 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT1P21579 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT1P21579 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT1P21579 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT1P21579 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT1P21579 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT1P21579 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT1P21579 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT1P21579 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT1P21579 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT1P21579 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT1P21579 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT1P21579 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT1P21579 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT1P21579 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT1P21579 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT1P21579 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT1P21579 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT1P21579 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT1P21579 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT1P21579 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms