Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A1P20849 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A1P20849 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms