Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms