Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NELFEP18615 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NELFEP18615 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NELFEP18615 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NELFEP18615 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NELFEP18615 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NELFEP18615 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NELFEP18615 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NELFEP18615 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NELFEP18615 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NELFEP18615 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NELFEP18615 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NELFEP18615 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NELFEP18615 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NELFEP18615 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NELFEP18615 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NELFEP18615 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NELFEP18615 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NELFEP18615 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NELFEP18615 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NELFEP18615 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NELFEP18615 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NELFEP18615 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NELFEP18615 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NELFEP18615 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NELFEP18615 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NELFEP18615 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NELFEP18615 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NELFEP18615 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NELFEP18615 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NELFEP18615 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NELFEP18615 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NELFEP18615 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NELFEP18615 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NELFEP18615 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NELFEP18615 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NELFEP18615 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NELFEP18615 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NELFEP18615 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NELFEP18615 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NELFEP18615 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NELFEP18615 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NELFEP18615 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NELFEP18615 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NELFEP18615 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NELFEP18615 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NELFEP18615 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NELFEP18615 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NELFEP18615 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NELFEP18615 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NELFEP18615 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NELFEP18615 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NELFEP18615 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NELFEP18615 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NELFEP18615 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NELFEP18615 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NELFEP18615 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NELFEP18615 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NELFEP18615 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NELFEP18615 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NELFEP18615 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NELFEP18615 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NELFEP18615 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NELFEP18615 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NELFEP18615 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NELFEP18615 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NELFEP18615 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NELFEP18615 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NELFEP18615 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NELFEP18615 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NELFEP18615 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NELFEP18615 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NELFEP18615 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NELFEP18615 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NELFEP18615 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NELFEP18615 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NELFEP18615 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NELFEP18615 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NELFEP18615 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NELFEP18615 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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