Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms