Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR1P18146 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR1P18146 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR1P18146 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR1P18146 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR1P18146 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR1P18146 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR1P18146 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR1P18146 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR1P18146 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR1P18146 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR1P18146 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR1P18146 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR1P18146 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR1P18146 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR1P18146 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR1P18146 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR1P18146 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR1P18146 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR1P18146 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR1P18146 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR1P18146 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR1P18146 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR1P18146 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR1P18146 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR1P18146 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR1P18146 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR1P18146 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR1P18146 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR1P18146 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR1P18146 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR1P18146 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR1P18146 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR1P18146 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR1P18146 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR1P18146 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR1P18146 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR1P18146 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR1P18146 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR1P18146 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR1P18146 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR1P18146 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR1P18146 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR1P18146 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR1P18146 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR1P18146 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR1P18146 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR1P18146 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR1P18146 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR1P18146 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR1P18146 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR1P18146 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR1P18146 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR1P18146 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR1P18146 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR1P18146 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR1P18146 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR1P18146 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR1P18146 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR1P18146 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR1P18146 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR1P18146 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR1P18146 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR1P18146 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR1P18146 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR1P18146 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR1P18146 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR1P18146 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR1P18146 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR1P18146 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR1P18146 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR1P18146 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR1P18146 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR1P18146 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR1P18146 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR1P18146 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR1P18146 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR1P18146 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR1P18146 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR1P18146 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR1P18146 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR1P18146 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR1P18146 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR1P18146 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR1P18146 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR1P18146 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR1P18146 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR1P18146 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR1P18146 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR1P18146 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR1P18146 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR1P18146 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR1P18146 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR1P18146 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR1P18146 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR1P18146 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR1P18146 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR1P18146 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR1P18146 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR1P18146 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms