Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XBP1P17861 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XBP1P17861 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
XBP1P17861 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XBP1P17861 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XBP1P17861 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XBP1P17861 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XBP1P17861 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XBP1P17861 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XBP1P17861 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XBP1P17861 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XBP1P17861 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
XBP1P17861 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XBP1P17861 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XBP1P17861 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XBP1P17861 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
XBP1P17861 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XBP1P17861 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XBP1P17861 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XBP1P17861 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XBP1P17861 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XBP1P17861 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XBP1P17861 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
XBP1P17861 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XBP1P17861 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XBP1P17861 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XBP1P17861 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XBP1P17861 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XBP1P17861 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XBP1P17861 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XBP1P17861 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
XBP1P17861 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XBP1P17861 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
XBP1P17861 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XBP1P17861 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XBP1P17861 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
XBP1P17861 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XBP1P17861 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
XBP1P17861 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XBP1P17861 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XBP1P17861 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XBP1P17861 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XBP1P17861 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XBP1P17861 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XBP1P17861 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XBP1P17861 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
XBP1P17861 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XBP1P17861 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XBP1P17861 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XBP1P17861 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XBP1P17861 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XBP1P17861 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XBP1P17861 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XBP1P17861 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XBP1P17861 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XBP1P17861 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XBP1P17861 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XBP1P17861 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XBP1P17861 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XBP1P17861 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XBP1P17861 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XBP1P17861 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XBP1P17861 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XBP1P17861 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XBP1P17861 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XBP1P17861 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XBP1P17861 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XBP1P17861 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XBP1P17861 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XBP1P17861 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XBP1P17861 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XBP1P17861 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XBP1P17861 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XBP1P17861 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XBP1P17861 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XBP1P17861 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XBP1P17861 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XBP1P17861 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
XBP1P17861 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
XBP1P17861 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XBP1P17861 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XBP1P17861 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XBP1P17861 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XBP1P17861 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XBP1P17861 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XBP1P17861 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XBP1P17861 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XBP1P17861 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XBP1P17861 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XBP1P17861 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XBP1P17861 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XBP1P17861 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XBP1P17861 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XBP1P17861 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
XBP1P17861 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XBP1P17861 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XBP1P17861 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XBP1P17861 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XBP1P17861 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XBP1P17861 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms