Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYN1P17600 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYN1P17600 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYN1P17600 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYN1P17600 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYN1P17600 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYN1P17600 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYN1P17600 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYN1P17600 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYN1P17600 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYN1P17600 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYN1P17600 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYN1P17600 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYN1P17600 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYN1P17600 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYN1P17600 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYN1P17600 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYN1P17600 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SYN1P17600 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYN1P17600 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYN1P17600 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYN1P17600 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYN1P17600 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYN1P17600 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYN1P17600 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYN1P17600 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYN1P17600 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYN1P17600 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYN1P17600 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYN1P17600 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYN1P17600 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYN1P17600 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYN1P17600 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYN1P17600 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYN1P17600 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYN1P17600 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYN1P17600 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYN1P17600 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYN1P17600 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYN1P17600 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYN1P17600 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYN1P17600 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYN1P17600 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYN1P17600 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYN1P17600 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYN1P17600 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYN1P17600 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYN1P17600 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYN1P17600 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYN1P17600 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYN1P17600 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYN1P17600 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYN1P17600 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYN1P17600 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYN1P17600 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYN1P17600 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYN1P17600 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYN1P17600 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYN1P17600 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYN1P17600 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYN1P17600 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYN1P17600 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYN1P17600 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYN1P17600 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYN1P17600 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYN1P17600 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYN1P17600 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYN1P17600 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYN1P17600 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYN1P17600 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYN1P17600 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYN1P17600 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYN1P17600 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYN1P17600 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYN1P17600 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYN1P17600 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYN1P17600 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYN1P17600 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYN1P17600 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYN1P17600 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYN1P17600 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYN1P17600 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYN1P17600 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYN1P17600 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYN1P17600 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYN1P17600 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYN1P17600 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYN1P17600 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYN1P17600 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYN1P17600 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYN1P17600 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYN1P17600 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYN1P17600 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYN1P17600 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYN1P17600 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYN1P17600 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYN1P17600 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYN1P17600 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYN1P17600 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYN1P17600 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms