Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKMT2P17540 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKMT2P17540 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms