Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB9P17482 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms