Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOT1P17174 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOT1P17174 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOT1P17174 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOT1P17174 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOT1P17174 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GOT1P17174 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOT1P17174 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GOT1P17174 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOT1P17174 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOT1P17174 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOT1P17174 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOT1P17174 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOT1P17174 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOT1P17174 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOT1P17174 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOT1P17174 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GOT1P17174 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOT1P17174 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOT1P17174 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GOT1P17174 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOT1P17174 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOT1P17174 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOT1P17174 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOT1P17174 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOT1P17174 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOT1P17174 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GOT1P17174 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOT1P17174 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOT1P17174 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GOT1P17174 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOT1P17174 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOT1P17174 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOT1P17174 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOT1P17174 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOT1P17174 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOT1P17174 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOT1P17174 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOT1P17174 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOT1P17174 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GOT1P17174 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOT1P17174 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOT1P17174 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOT1P17174 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOT1P17174 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOT1P17174 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOT1P17174 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOT1P17174 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOT1P17174 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOT1P17174 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOT1P17174 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOT1P17174 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOT1P17174 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOT1P17174 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOT1P17174 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOT1P17174 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOT1P17174 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GOT1P17174 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOT1P17174 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOT1P17174 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOT1P17174 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOT1P17174 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOT1P17174 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOT1P17174 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOT1P17174 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOT1P17174 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOT1P17174 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOT1P17174 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GOT1P17174 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOT1P17174 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOT1P17174 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOT1P17174 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOT1P17174 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOT1P17174 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOT1P17174 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOT1P17174 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOT1P17174 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOT1P17174 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOT1P17174 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOT1P17174 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOT1P17174 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOT1P17174 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOT1P17174 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GOT1P17174 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOT1P17174 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOT1P17174 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1P17174 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1P17174 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1P17174 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1P17174 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1P17174 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1P17174 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1P17174 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1P17174 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1P17174 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1P17174 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1P17174 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1P17174 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1P17174 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1P17174 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms